《五星红旗迎风飘扬2》承接“两弹一星”的故事，从1970年4月我国第一颗人造卫星上天写起，着力塑造毛泽东、周恩来、邓小平等老一辈革命家运筹帷幄，在复杂多变和严峻的国际环境中，审时度势，从容应对，始终立于主动地位。为了维护祖国的主权、领土完整和民族尊严，他们进行的坚定而有理有力的斗争，在严重困难面前，他们带领全国人民，迎难而上，以不屈的姿态和昂扬的精神面貌去战胜和克服困难，终于走出了一条中国特色的社会主义道路。
该剧讲述的是四个白领丽人各自不同的情感历程和人生变迁。林宝珍（郭可盈）、杨美兰（梅小惠）、庄泳琳（刘锦玲）、丁晓雯（江欣燕）四个性格迥异的白领丽人因为工作关系成为要好朋友。 林宝珍和杨美兰及庄泳琳三个人均已结婚，并都为自己找到归宿而感到满意，不料他们所托负终生的人并非君子良人，复杂的社会人际关系，充满了各种诱惑，而且这诱惑往往是致命的陷井，林宝珍的丈夫吕家安（张国强）搭上患有精神病的情妇，本打算一夜风流的安被情妇死死缠住，险些导致家破人亡，恶梦醒来，恍如隔世。 杨美兰的丈夫王志祥（海俊杰）作投机生意欠下巨额债务，以致被债主逼得走投无路，为了还债，竟然丧尽天良，欲杀妻子谋取巨额保险金，好在阴谋没有得逞。庄泳琳的老公简兆天（魏骏杰）是占有欲极强，妒忌心极重的小男人，只是因为太爱庄泳琳而走向极端并常虐待她，以致俩人感情破裂，最终三个人几经风雨，几经波折，终能与各自的丈夫解除婚姻，重新成为“自由人”。 聪明能干的丁晓雯是四个女人中唯一待字闺中的单身女郎，她对终身伴侣的要求极高，终于她遇上梦寐以求的白马王子，但结果却换来了惨痛的经历。尽管这样，四个人的爱情和生活的路上，终于重新振作，勇敢面对未来。
海关督察浩辉（王喜 饰）负责驻守机场，他在一次行动中成功破获了一起利用人体带毒的大案，深受赞赏。与此同时，海关调查局的另外一组同事在缉拿私烟集团的行动中失手，领队的李督察更是受伤入院。于是上级将表现出色的浩辉调过来担任这组的领队。浩辉刚一上任，沙展叶天华（欧阳震华 饰）就对他的办案手法十分不满，但浩辉并没有受他影响，依然我行我素。这日，海关接到线报上次私烟集团的头目江世仁准备离境潜逃，于是浩辉带领一班部下赶往缉拿。浩辉利用自己的机智成功制服江世仁，天华乘机将他打了一顿。原来，天华的女友死跟他调查私烟集团有关，他曾发誓一定要将私烟集团彻底铲除。江世仁最终被判刑，浩辉在出庭作供时对美丽能干的检察官尚怡（谭小环 饰）产生了好感，对她大加赞赏。浩辉原以为此案终于告一段落，然而天华继续执着于调查幕后主脑以及同事们的劝说，浩辉终于又继续着手调查。一班缉私精英最后能否将幕后黑手绳之于法？
故事发生在民国初年，潘家世代经营着永泰隆丝绸厂，在当地家大业大，根基稳固。潘家显（麦长青 饰）虽然身为长子，却因为能力不足个性软弱而无法承担家业，反而是妹妹潘巧儿（康华 饰）巾帼不让须眉，肩负着沉重的责任，将一切打理的井井有条。三子潘家扬（马浚伟 饰）深受父亲的喜爱，却一心沉迷于研究医学，早已离家。 冼碧云（邵美琪 饰）是潘巧儿手下的女工，亦和潘家显有着一段尘封的感情。只是最后，懦弱的潘家显选择顺从父母之命，迎娶了富家小姐杨艳桃（叶翠翠 饰）。某日，久无音信的潘家扬忽然现身，推动了潘家命运的齿轮，就在大家沉浸在潘家扬回归的喜悦之中时，等待着众人的却是潘巧儿冰冷的尸体。
曾经贵为香港重案组高级督察的司徒舜（郑嘉颖 饰）过于依赖天眼系统，虽然这种办案方式帮他找到许多破案的关键和证据，却也将他潜入了纵火、毒品的陷阱。为了追查陷害他的真凶，司徒愤而辞职，后在友人介绍下进入一家保安公司担任保安经理，他凭借多年积累的办案知识很快成为该公司的得力干将，在此期间他与新加入公司的郑力行（陈展鹏 饰） 惺惺相惜，情同手足。某次意外，让司徒邂逅私家侦探吴珍妮（杨怡 饰）。这次相遇令司徒重新看到查清纵火真相的希望，同时发现珍妮仿佛拥有某种特殊的能力。 二男一女携手办案，奇妙的感情故事也悄然发生……
祁乐（岑丽香 饰）、邓励帧（刘佩玥 饰）、汪佩仪（吴沚默 饰）、陈拔萃（陈康健 饰）、俞玥爱（吴若希 饰）和朱世勤（唐嘉麟 饰）是在同一所大学就读护理学系的同学兼好友。毕业前一年，六人来到了同一家医院实习，其中，祁乐等四人被分配到了魔鬼教官杨志明（洪永城 饰）手下的病房，日子过得苦不堪言。 祁乐一行人很早就看不惯杨志明跋扈的作风和张扬的个性，再加上护师杜羡花（姚子羚 饰）对杨志明的长久不满，一场恶战在医院内部打响。那边厢，顾问医生唐日俊（单立文 饰）爱上了温柔善良的杜羡花，这段恋情让唐日俊的旧情人卓芝君（陈炜 饰）心中很不是滋味。
