境外某跨国贩毒集团勾结东山当地不法分子进行大规模的地下冰毒生产，以达到将大量冰毒销往中国内陆省份及海外以获取高额利润的目的。 在此复杂危险的环境下，以李飞为代表的缉毒警不畏牺牲拼死撕开当地毒贩和保护伞织起的那张巨大的地下毒网，并冲破重重迷局，为“雷霆扫毒专项行动”的顺利展开扫清障碍。
故事的主人公是反恐特战队队长钟原，他在执行任务中成功击毙了猛犸组织的二号人物，却因此引来了该组织的复仇行动。在解救妻子赵欣的过程中，钟原不幸被注射了一种病毒，导致他倍受折磨。与此同时，DK生物公司的董事长江寒（何晟铭 饰）邀请赵欣（牟星 饰）及其父亲参加公司的“有益菌”研究项目。赵欣是生化专业的高材生，也是钟原的初恋情人。在钟原所在的反恐指挥中心得知T国的请求后，决定派遣专家潜入DK公司调查。 赵欣在失去爱子后主动请缨“退出现役”，深入虎穴，开始调查有关DK公司的情况。随着一系列接连不断的恐怖事件发生，一个名为“新纪元计划”的阴谋逐渐浮出水面。钟原尽管身处病痛之中，仍然率领乔大鹏、麦萌萌等特战队员，决定绝地出击。在他的爱妻赵欣和五年前“失踪”的战友陆豪的协助下，他们成功粉碎了恐怖组织的连环阴谋和生化袭击，揭露了江寒利用“有益菌”制造病毒的真实计划。
富士电视台春季“月九”！木村拓哉饰演总理大臣。 木村拓哉在剧中本来是一个小学教师，但由于一次意想不到的事情，涉足了政界，最终成为总理大臣。剧中描写到他被一些老谋深算政治家的捉弄，也有他和立志强国的人一起奋斗。
