2019年，珠宝劫案悍匪陈祖耀（袁伟豪饰）的冷血一枪，改写四位机动部队警员的命途。五年后，四警当中，只剩关智轩（陈山聪饰）留守机动部队；徐国贤（张振朗饰）退出警队，更加入了黑帮……智轩偕拍档苏国威（张颖康饰）领着机动部队新组员，协助反黑组督察彭颖琪（朱晨丽饰）抓捕毒贩，竟再次遇上祖耀！祖耀一心要向人称「西九王」的毒枭无良（黄子恒饰）报仇，其后祖耀成功复仇，却沒有令西九变得太平。各方恶势力崛起，西九反黑组和机动部队为维护社会安宁，与黑帮周旋，激战连场，无日无之！
故事围绕着一位名叫王琦瑶（黄奕 饰）的美丽女子展开，她的美丽为她带来了福音，却也带来了灾难。在“上海小姐”的评选之中，王琦瑶意外的获得了第三名的好成绩，这一殊荣吸引了有权有势的李主任（吴兴国 饰）的目光，李主任将王琦瑶带入了一个新的世界之中，但不幸的是，两人的感情并没有得到善终。 之后，王琦瑶遇见了富家子弟康明逊（徐峥 饰），可动荡的局势很快又将两人分开，腹中怀有康明逊的孩子，王琦瑶陷入了绝境之中。时间推移，又有很多的男人出现在王琦瑶的生命之中，但很快就不见踪影，直到这时，王琦瑶才想起了最初的那位程先生（谢君豪 饰），而此时的程先生早已因病去世了。
剧情的背景其实就是在原著的基础上，做了些科幻式的改编。原著中的黑暗、混沌在这里成了太阳黑子爆发，而原本的一个石猴的问世变成了三颗陨石的陨落和神化。要打败天魔，惟一方法是要某年某月某日某时某刻某分某秒出世的人，由其中一颗陨石的化身护送他到西天取三藏真经。
