魔法少女与恶曾是敌人。

在一次交通事故中，小林哲平（寺岛拓笃 配音）永远失去了双亲，这时，外祖父有马一心（若本规夫 配音）出现在了哲平的面前，他希望哲平能够成为他的继承人，继承庞大的有马集团。为了成为一个有担当的男人，也为了替父母报仇，哲平搬进豪宅，入驻贵族学院秀峰学园，发誓要成为一个大家都能看得起的上流社会精英。                                                                      　　在祖父家，哲平结识了骑士后裔西尔维娅（丰口惠美 配音），她果断飒爽的个性吸引了哲平的注意。与此同时，大小姐凤条院圣华（加藤英美里 配音），女佣藤仓优（松冈由贵 配音）也相继出现在了哲平身边。在学院中，哲平与曾经一见钟情的公主夏洛特（柚木凉香 配音）相遇了，这意外的重逢更是为哲平的生活添上了浓墨重彩的一笔。

讲述在“神化”时代的东京，充斥着无数的英雄——“超人”。他们的诞生理由各有不同。既有被邪恶组织改造的人，也有来自宇宙的人。既有来自魔法世界的人，也有来自古代、身为妖怪而生的人。既有被科学家制造出来的机器人，也有超自然的史前机器人。对于这些超人的跋扈，日本政府绝不打算坐视不管——

在“神化”时代的东京，充斥着无数的英雄——“超人”。                                                                      　　他们的诞生理由各有不同。                                                                      　　既有被邪恶组织改造的人，也有来自宇宙的人。                                                                      　　既有来自魔法世界的人，也有来自古代、身为妖怪而生的人。                                                                      　　既有被科学家制造出来的机器人，也有超自然的史前机器人。                                                                      　　对于这些超人的跋扈，日本政府绝不打算坐视不管——

升上高中二年级的香澄等Poppin'Party成员，不论是在学生会还是在家帮忙，不论是补习还是打工都十分繁忙。五人在一起的时间逐渐减少，在作为据点的仓库也难以集合。在这样的她们身边，出现了一位少女——。全新的邂逅。不变的羁绊。Afterglow、Pastel＊Palettes、Roselia、Hello、Happy World！也陆续登场，个性丰富的乐团成员们，在闪耀而令人心动的舞台上引人陶醉！“还想要和大家一起举办Live”，音乐梦想如今开始奔跑！

ポピパ主催ライブから4ヶ月。楽しい夏休みを経て、季節は秋。                                                                      　　蔵練、バイト、生徒会――いつもの日々を過ごす香澄たちPoppin'Partyは、                                                                      　　ライブハウスGalaxyで、あるポスターを見つける。                                                                      　　一方、運命のバンドメンバーを探す六花の元に、一通の招待状が届いて……                                                                      　　再びはじまるキラキラドキドキなステージ！                                                                      　　みんなと一緒なら、どんな夢だって撃ち抜ける！

　　沃斯帝国公主艾瑟依拉姆·薇瑟·艾莉欧斯亚（アセイラム・ヴァース・アリューシア）以亲善大使的身份访问地球，在其身后目送其离开的则是于地球出生而在火星上长大的少年斯雷因·特洛耶特（スレイン・トロイヤード）。然而，她的游行车队随后在新芦原市遭到恐怖分子的导弹攻击，前线的火星骑士将其视为地球的宣战公告，纷纷将停驻于地球卫星轨道的扬陆城降落地球，对世界各国展开攻击，地球与火星间的战火再次爆发。

　　约四十年前，人类在火星发现史前文明“Aldnoah”科技。伴随着火星殖民进程与科技垄断主张，火星开拓民与地球之间的摩擦越发扩大。
　　2014年，处于休战状态的地球与火星正在进行和平谈判。火星“薇瑟帝国“公主艾瑟依拉姆（雨宫天 配音）以亲善大使的身份访问地球，为打破坚冰做出努力。她的游行车却在日本新芦原市遭到恐怖分子的导弹攻击。火星帝国将其视为地球的宣战公告，随即对地球各国发出攻击，两个星球间的战火再次爆发。受过格斗技与人形战斗兵器训练的地球高中生界冢伊奈帆（花江夏树 配音）与伙伴们加入机甲骑兵战斗。与此同时，公主的侍从斯雷因（小野贤章 配音）亦卷入战争，为救出帝国公主而努力。

　　鱼住陆生（小林亲弘 配音）是一个无论是长相还是性格都非常普通的男人。大学毕业之后，陆生并没有削尖了脑袋想要挤进大企业里，而是选择去便利店成为了那里的一名打工人，所有人都对陆生的选择表示不解，但陆生脑中有着他的算盘。
　　森之目榀子（花泽香菜 配音）在一所高中里担任代课老师的职务，因为曾经的一段悲惨经历，导致榀子紧紧的封闭起了内心，不再接受任何人的关怀。陆生喜欢上了这样的榀子，默默的守候在她的而身边。野中晴（宫本侑芽 配音）是早早就离开了家走上了社会的早熟少女，在机缘巧合之下她喜欢上了陆生，并且知晓了他对榀子的感情。

　　新学期刚开始，高中生·坂井悠二一如往常过着“日常生活”。然而有一天，他冷不防遭遇红世之王手下的侵袭。受到一名能够把人的存在化为灵火，并吸取灵火的神秘男子法利亚格尼的攻击。悠二的“日常”生活因此整个脱节，然而就在同一时间，一名少女出现在他面前。
　　少女为了保护悠二不被法利亚格尼袭击，开始与悠二一同生活。悠二满怀感激向少女道谢，不料少女却如此低喃：“你已经不存在了。”
　　我已经死了？存在丧失者·悠二为何还能够思考呢……

　　《灼眼的夏娜》TV第二季的故事将从小说第八卷开始讲起，以NDS游戏《灼眼的夏娜DS》中的登场人物，红世之徒，戏睡乡“メア”入侵御崎市开始开篇。据监督渡部高志所说，故事会对第一季的一些伏笔作出解释，并加入不少这个时代的小故事。第二季STAFF和声优会由原班人马担任，“钉宫之誓”依旧强势走高。
　　夏天结束后，新学期开始了
　　许多事物没有任何变化，但是同时也有不少事情逐渐发展着…
　　池和吉田，绪方和田中之间产生了些许微妙的关系
　　还有在我身旁，飘逸着长发的夏娜…
　　但是，这一切似乎有着一丝奇怪的违何感
　　在我们所不知道的地方，红世之徒再次展开了行动…

　　闹得沸沸扬扬的《灼眼的夏娜S》新企画，在电击文库MAGAZINE7月号终于公布了事件的真相——《灼眼的夏娜S》将在年底推出新作动画OVA，并在近日告知了OVA系列总共将制作4卷，且蓝光与DVD同期发售的消息，制作团队依然由J.C.STAFF的渡部高志班负责，当然，既然是OVA原作补完之类的完全不可能出现。故事描述的是夏娜与悠二因宝具的效果而导致精神互换的番外篇，DVD与蓝光第一卷将于2009年10月23日开始发售，售价分别是5,775日元、6,825日元。比起TV动画第一季的OVA，本期OVA的欢乐指数明显不及格