广东卫视《秘境神草》第三季摄制团队历时两年，行程达数万公里，足迹遍布华夏大地，天南地北的荒野乡村，以一种特殊地貌、一户普通人家、一味野生本草、一段人生故事为线条，在神奇壮美的大场景里，通过多种拍摄技术手段，纪录人们寻访野生本草的足迹。节目题材的季节性特别强，地域广泛，七集节目主题，通过30多个题材故事巧妙布局，以《绝地本草》、《甘苦之奇》、《玄妙入药》、《荒野珍馐》、《险境探骊》、《药生山林》、《琪花瑶草》等七集节目，深入纪录民间采药人的生活，向人们深入铺叙人与自然、 人与本草的中国故事。
宇文峰（郑少秋 饰）出身武当，勤学苦练，身手了得，学成下山后，宇文峰受到了当时最大的兵器工厂唐门的赏识，门主更是将女儿唐碧（汪明荃 饰）许配他。哪知道唐门突遭不幸，被诬陷勾结外族，落得满门抄斩的下场，而宇文峰则被打入大牢，即将问斩。太监张诚（陈鸿烈 饰）欣赏宇文峰的身手为人，以替他卖命作为条件，救下了宇文峰。 那边厢，唐碧死里逃生，之后成为了京城第一大镖局的女当家，丈夫死后，唐碧接管了镖局，并且最终凭借她的智慧和能力获得了周围人的认可。宇文峰加入了锦衣卫，受张诚胁迫，干尽了伤天害理之事，一次偶然中，宇文峰和唐碧重逢了，一段旷世情缘再度拉开帷幕。
一次意外使得干探于子朗（郭晋安 饰）具有了通灵的能力，能感应死去的冤魂传递给他的点点滴滴的信息。子朗本来就精明能干，这下更是如虎添翼，屡破奇案。才华出众的他却受到了上司的嫉妒，于是借口特别凶案调查组的上司准备退休，到那里很快就能升职将他调到了那个警局神憎鬼厌的部门，D. I.E.。与此同时，Madam 刑（郭羡妮 饰）因为过于想表现自己而屡屡闯祸，结果遭到多方投诉而被上司打发到了D.I.E.。Madam 刑和子朗来到这里都发现这里的人十分奇离古怪，由于两人都一心想着接替即将提休的上司的位置，于是两人结成了冤家，展开了一番明争暗斗。幸好随后两人握手言和，子朗更是暗恋上了Madam 刑，两人一起携手为那些沉冤待雪的冤案伸张正义。
幼稚园老师乔花枝（陈慧珊 饰）与母亲、继父过着安稳的生活。一天她收到一封有关继承生父江耀柱的百里香餐厅的律师信，但餐厅里根本没有出色的大厨，于是她到处寻找天才厨师马友（吴启华 饰）。但性格冷傲的马友因感情受挫无法再品尝美食而不再出任大厨。原来马友本是孤儿，幸好遇到启蒙老师耀柱。为了报恩，马友最终报答了花枝担任餐厅大厨。花枝同父异母的弟弟江上游（林峰 饰）对这两名突入其来进入餐厅的人充满敌意，但同样为了父亲的餐厅，三人开始互相合作，上游与马友也开展了一段亦师亦友的关系。 花枝与马友日久生情，但令马友昔日情人苏眉（滕丽名 饰）再次出现了。而花枝也认识了当年与马友共同学艺的赐新（马德钟 饰），能力与信心十足的赐新在厨艺的地位斐然。但令赐新耿耿于怀的是天才厨师马友，两人至此一直没有比出高低。 赐新重新把马友看作是事业上与爱情上的对手，于是向马友下了战书。百里香的存亡与爱情的选择使马友倍感压力……
