数千年后的未来,进入宇宙空间的人类,被分为银河帝国与自由行星同盟这两个拥有“专制政治”与“民主主义”两种不同政治体制的国家。两国之间的抗争持续了150年,以无边无际的广袤银河为舞台,重复着无止境的战斗。银河帝国的门阀贵族社会的腐败,以及在自由行星同盟中被称为“民主主义的弊端”的群愚政治正侵蚀着两个国家。之后,宇宙历8世纪末,两位天才的登场驱动了历史。“常胜的天才”莱因哈特·冯·罗严克拉姆,以及人称“不败的魔术师”的杨威利。两人率领着帝国军与同盟军,展开了不知道是第几次的冲突。
从行星波利斯逃脱等待重返地球的空间盘龙号,自称“雷奥尼克斯猎人”的神秘男子侵入其中。同时,其他的宇宙人们也正暗中开始行动,ZAP SPACY的船员们被捲入了这场争斗的漩涡中。就像凯特的遗言一样,崭新的雷奥尼克斯格斗已经开始了!?
已经迎来了宇宙开拓时代的人类,组成了为开采在宇宙行星的资源进行支援的战斗组织[ZAP SPACY] 。 『超级银河—大怪兽乱斗』正是以[ZAP SPACY]的宇宙运输船船员们而展开的故事。 他们更改了当初的航行计划,并驶向了宇宙的边境行星——波利斯。 正是因为来自波利斯的定期联络突然被中止。 而原因却不明…… 不久到达波利斯的4名队员,等待着他们的却是波利斯已被荒废的惨状。4人正准备调查此事时,面前出现了巨大的身影…… 那是以前在地球出现过,但是大部分人认定现在已经灭亡了的怪兽!!! 就在同一时刻 出现了能够驾驭怪兽的青年——(レイ)零 他到底是什么人? 想象一下!激烈程度达到顶点的战斗就要开始了──!