21世纪。人类终于实现了与其他智慧生命体的接触。但，这一相遇却并非幸福之物。 从地冥界侵入的怪物，将大多数现代兵器无效化，人类的命运如同风中残烛。 但在同样为地冥界所苦的精灵环境条约机构的协助下，人类获得了起死回生的一着棋。那就是魔法少女。 获得强大魔力的少女，即使在身心多处负伤的同时，仍然将人类引导向胜利，并终于使大战结束。 但，这只不过是新的战争的开端而已。国际犯罪、无差别恐怖袭击、内战、纷争……。 魔法少女的战斗没有结束——
STORY（翻译：jinforever） 女主人公奏怀揣着满心期待与些许的不安进入了这所学园。 然而才刚入学她就闹出了大问题，由此而缺勤了将近一年。 同时她开始在家中闭关不出，不知从何时起，她甚至开始惧怕与人见面，不敢迈出家门一步。 每天，她都在房里提醒自己，这样下去不是办法。但她也无力改变这样的现状。 成天无所事事，任时光从指缝中悄然流逝。 主人公渐渐开始对自己空虚的生活感到恐惧。 心中的不安与日俱增，更是阻挡住了她走向外部世界的脚步。 于是就在某一个夜晚，主人公做了一个梦。 「试着向外面迈出一小步吧」 「下定决心，把刘海剪短…摆脱过去，创造一个全新的自己」 「来…――――到外面」 那不可思议的声音说完这些，便戛然而止。 主人公在迷迷糊糊间再次坠入梦乡。 怎么可能……到外面去呢…… 但翌日清醒之后，她却一直无法忘却这个奇妙的梦。 第二天。 她努力抬起自己那沉重而又抗拒外出的双腿。 慢慢打开那紧闭多时的卷帘窗。 接着，将微颤的手伸向大门。 似乎是被梦境所推动般——主人公奔向了外面的世界。
上杉达也（三矢雄二 配音）和上杉和也（难波圭一 配音）是一对孪生兄弟，与住在隔壁的浅仓南（日高法子 配音）从小一起长大。三人都进入了明青学园就读。虽为双胞胎，但达也和和也的性格全然相反。和也是学校女生的偶像，棒球队的王牌；而达也则懒散，对什么都满不在乎。学校里，和也和小南是公认的完美的一对。达也也觉得二人的般配，只在心里默默的喜欢着小南。但小南则似乎总是有意无意的接近关心着达也。 和也率领着棒球队打到了进入甲子园的关键一战，在决赛的前晚，和也表达了对小南的爱意，但小南并未回应。第二天早晨，一切亦如往昔，但变化说来就来。在去集合的路上，因救小孩而出车祸的和也抢救无效，长眠在了夺取胜利的路上，也终止了带小南去甲子园的约定。在这个悲伤的夏天，达也决定拾起弟弟未完成的梦想，加入了棒球社。去往甲子园的路漫长而曲折，小南也璀璨如遥远的星，但一步步坚定的前进终将会迎来Touch到他们的一天。
2017年7月14日起，在YouTube的“KADOKAWAanime频道”上架AT-X和网络电视光TV于每集正篇播完之后追加的短篇动画《咕噜咕噜魔法阵 小剧场 冒险之书（グルグルぷちあにめ劇場 ぼうけんのしょ）》（仅在上架后的两周内公开），内容为补充正篇删除的部分内容。
故事发生在未来的世界之中，彼时，人类已经可以在日常生活中使用少量的魔法月白瞳美（石原夏织 配音）是拥有着魔法使血统的魔族末裔，虽然能够使用魔法，但是在生活里月白一直都对此十分回避。月白自幼患有色觉障碍症，无法看到颜色，生活在黑白世界中的她因此性格也十分的压抑和冷漠。祖母非常担心月白的未来，于是施法将她送回了2018年的长崎。 在60年前的长崎，月白遇见了还是高中生的祖母琥珀（本渡枫 配音），更让月白感到惊讶的是，自己眼前的世界竟然变得绚丽多彩起来。热衷于画画的葵唯翔（千叶翔也 配音）、温文尔雅的山吹将（前田诚二 配音）、开朗乐观的川合胡桃（东山奈央 配音），在这里，月白很快就交到了朋友。
