1940年，多方势力盘踞南京，特工金深水（张译 饰）终日周旋于日本军方、汪伪政府和军统之间，如同行走于刀尖一般，有着多重身份的他，在满目疮痍的南京城里小心翼翼地活着，隐藏着真实的自己，也寻找着自己乃至整个民族的生路。直到他遇到了和他一样心怀国仇家恨、却似乎比他更游刃有余的林婴婴（郎月婷 饰），在和她并肩作战与各方势力展开明争暗斗的过程中，于乱世中求生的金深水第一次开始真正地觉醒……
在犯罪手法越来越精进的今日，对於刑警办案的技巧、鑑识员分析的技术要求相对性提高。为了因应科学的办案精神，日本各县内警署都设有科学搜查研究所，简称为「科搜研」。「科搜研」的业务内容不但包括毛髮、血液、声纹、DNA的鑑定，甚至测谎、颜面恢复等工作。虽然他们不是站在逮捕犯人的第一线上，但却是帮助釐清真相、寻找兇手的重要人物。 本剧藉由活跃於科搜研内，性格独特的麻辣女法医-真理子的办案过程，让大家能够深入一窥科搜研的神秘世界。 主角真理子是京都府警‧科学搜查研究所的法医研究员。在工作上拥有丰富的专业知识，对於犯罪事件也有异於常人的敏锐度，因此常能顺利破解奇案。不过在私生活方面，却是一位离了婚的单身女子；由於固执骄傲及易於动怒的性格，让她与同事间衝突不断。
一次法庭辩论中，律师倪博文（刘松仁 饰）的辩护令女警舒敏（米雪 饰）辛辛苦苦捉拿归案的犯人获得了无罪释放的判决，心里很是不服气的舒敏开始处处和倪博文作对。然而，最终事实证明，错误的一方的确是舒敏，感到十分脸红的舒敏找到了倪博文向他道歉，一段奇妙的情缘就此展开。 倪博文和舒敏结了婚，两人的感情十分要好，可是，这段婚姻却伤害了一直痴恋着倪博文的傅雪薇（叶玉萍 饰），即便深深爱恋的男人已经成家，傅雪薇也没有放过任何能够接近他的机会。在傅雪薇的搅和下，夫妻两人因为误会而产生了嫌隙，一对天设地造的恋人即将一拍两散。
1935年，听闻父亲方玉龙的死讯，方云天告别了日本的留学生涯，回到中国上海，准备接管父亲方玉龙的拜把子兄弟高信义暂时托管的家族事业，偶遇的沈如画和方云天在互相斗气逗乐中互生好感。在沈如画的父亲沈富贵的安排下，两人成亲，高文轩大受打击。方云天旧日恋人日本女孩川岛云子随同父亲来到上海寻找方云天，当她得知方云天已经成亲，伤心欲绝。方云天跟高文轩兄弟反目，争霸上海滩。川岛云子的父亲来到中国利用女儿与方云天等展开一幕幕惊心动魄的谍战较量。最后，方云天在危难时局下带着沈如画参加了抗战。
