这个星球上生活着不可思议的生物神奇宝贝。现在开始讲述少年小智和神奇宝贝们的相遇、冒险和战斗经历的故事。 在结束了在成都地区的旅行后 小智只带上了他最先获得的神奇宝贝——皮卡丘 来到了芳缘地方。但是在到芳缘地方的途中，皮卡丘被火箭队的攻击变得异常奇怪... 在AG中，小智和新加入的女主角——小遥，永远支持着小智的小刚，以及小遥的弟弟小胜，一起在芳缘地方，以及到对战开拓区旅行
这是个发生在冬季和春季之间的故事。 在伊豆享受了愉快的团体露营的抚子、凛、千明、葵、惠那怀抱着对露营的热情，于山梨和静冈一带挑战各式各样的户外活动。凛和抚子的青梅竹马「土岐绫乃」一起前往大井川周边展开机车露营；而抚子为了和凛等人会合，搭上电车开展了单人旅程；千明、葵、惠那则即兴前往山梨北部展开一场公车露营之旅。她们五人将各自在不同地方活用之前学到的露营经验，靠着临场反应和气势度过难关，尽情享受露营的乐趣！就这样，「开心的回忆不断增加」的抚子等人编织而成的户外派女孩们的故事，即将展开新的篇章
饕餮大军降临天河市，雄兵连奉命出战。在开战惨遭先手的情况下，有序重新组织队伍组织反击，以南海舰队的全部火力一举击沉饕餮先头部队的主力火力舰后最终取得胜利。 但与此同时，天使集团、恶魔集团的行动渐渐浮出了水面，世纪大战一触即发！
11000年前，宇宙高等文明德诺文明爆发内战，烈阳星主神太阳之光毁灭了德诺星系。诺星上将杜卡奥携带德诺星系的神河超级战士基因来到银河系地球。 公元2017年，烈阳星太阳之光蕾娜来到处于核前时代的银河系地球文明，同时隐藏于地球上的神河基因得到了激活，率先觉醒基因的是划破虚空的银河之力和弑神之力诺星战神。与此同时，监视地球神河基因许久的三个集团，天使集团、恶魔集团、超神学院各自行动。华夏超神学院率先迅速行动将分散于地球的神河超级战士聚在超神学院，取名代号——雄兵连，由太阳之光蕾娜担任队长指导战士们进行先进的尖端对抗战术学习。 恶魔女王莫甘娜化名凉冰来到地球暗中传播堕落自由主义，谋划着如何消灭神圣凯莎。 天使集团派出左翼护卫彦为首的代表前往地球，而天使彦告知，冥河文明饕餮先头部队已直逼地球。 同时，天使集团、恶魔集团的行动渐渐浮出了水面……
