在火星发现的神秘箱子――“潘多拉魔盒”打开的瞬间，巨大的墙壁突然出现！故事由此开始。被称为“天空之墙”的墙壁把日本列岛分割为三部分，并由此诞生了各自的首都「东都」「西都」「北都」。 其中在“东都”有被称为Smash的未确认生命体出现并暗中把人类逼入绝境。挡在Smash面前而出现的，是一位青年，其腰上戴着腰带、 手上握着不可思议的瓶子 。「变身！」―― 青年天才物理学者变身为假面骑士Build，阻挡在Smash的面前！
故事发生在某所高中之内，青木（道枝骏佑 饰）在考试的时候因为忘带橡皮擦而陷入了焦头烂额的境地，此时，是青木一直暗恋的女生桥下（福本莉子 饰）将自己的橡皮借给了他，替青木解了围。正当青木反复品味内心的甜蜜时，他震惊的发现桥下的橡皮上写了同班同学井田（目黑莲 饰）的名字，很显然，桥下喜欢的是帅气而又冷酷的井田。 结果，井田好死不死的看到了这块橡皮，为了帮助心爱的女孩守住她暗恋的秘密，青木挺身而出说这块橡皮是自己的。就这样，一场青涩的初恋由一个小小的误会和一个无伤大雅的谎言为开端，缓缓展开。
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